针对深圳湾航道疏浚工程（一期）环评文件造假一事，4月16日，深圳市生态环境局通报调查进展时称，广东省生态环境厅派员参与造假事件调查，目前，省市联合调查组已完成对编制单位的调查取证，案件进入立案处罚阶段。下一步，深圳市生态环境局将继续严格依法做好案件办理工作，并及时向社会公布处理结果。
近日，深圳市交通运输局官网发布的深圳湾航道疏浚工程（一期）环评报告书被指涉嫌抄袭。报告书多处出现湛江字眼，涉嫌抄袭湛江航道疏浚项目环评，例如，环评中写道“深圳湾航道疏浚工程是落实湛江市国民经济和社会发展‘十三五’规划的体现”，“项目建设可实现‘以湛江港为龙头，充分发挥其作为西南沿海地区主枢纽港的辐射功能，在湛江湾、雷州等地布局建设若干港口物流基地’的目标”。在项目生态评价上竟然出现了“项目不会对湛江湾现有红树林造成明显不利影响”等字眼。
3月27日晚，深圳市交通运输局官微就环评报告书涉嫌抄袭一事回应称，将终止目前正在开展的该项目环评公示，立即责成环评单位中国科学院南海海洋研究所重新组织开展环评，对项目实施可能对周边生态环境造成的影响，包括红树林、鸟类、水质等，重新进行认真、细致、全面的评估。
3月28日，中科院南海所在其官网对环评涉嫌造假一事发布声明称，3月27日获知此事后，研究所领导高度重视，立即成立调查小组对相关情况开展调查。经查，该事件中涉及项目，确系由中科院南海所注册环评工程师承担。目前该所对事件正全面调查，并核实相关情况，如发现存在有违法违规违纪行为，将按规定对相关人员进行严肃处理，后续将及时对外发布。
对此事件生态环境部新闻发言人刘友宾在例行发布会上回应称，在建设单位自主公示阶段，环评文件暴露出的抄袭、造假问题，性质十分恶劣。环境部已迅即责成广东省、深圳市生态环境部门依法严肃查处，并要求将处理情况及时向社会公开。
为防止此类环评造假事件再次发生，刘友宾表示，环境部将进一步加强监管，坚决遏制环评文件造假和粗制滥造等问题，切实提高环评文件质量。